屠宰過程中將產生一定的屠宰后清洗、解體沖洗、地面沖洗等廢水。這些廢水中的脂肪、蛋白質等物質不經過處理，直接排入水體，將對其周圍水體造成嚴重富營養化，嚴重破壞水體的自盡能力,造成水體發黑變臭，影響環境和農業灌溉。由此，屠宰廢水處理成了一個*的環節，以下則是屠宰廢水處理設備的具體操作流程：
(1)屠宰廢水富含大量的漂浮物(血污、毛皮、雜物 、染物等等)，可用格柵予以攔截，以保證后續設備的正常運行，而此設施屠宰場現在已經具有。
(2)屠宰廢水富含血污、油脂等大分子有機物，直接進入好氧將很難降解，因此格柵出水之后進入化糞池。
(3)屠宰廢水處理設備場現有化糞池能夠起到一定的處理效果，但其出水濃度依然很高并夾帶部分油脂，減輕后續處理設施的負荷，可在前端加一座油水分離的隔油池以去除油脂。
(4)屠宰場因為工作時間的因素，其排水周期跟其它廢水排放周期不同，主要集中夜間排放，必須設置一個較大的調節池來調節水質水量以保證整套設施的正常運行，減輕對后續設施帶來的沖擊負荷，廢水經調節池收集然后通過泵泵入后續處理設施。
(5)屠宰廢水經過前端化糞池處理后，廢水中依然含有大部分大分子有機污染物，需要進一步對其降解為小分子物質，為后續好氧生化做準備，并考慮到廢水中氨氮和總磷的超標，必須設施好氧—缺氧的交替運行環境來達到硝化—反硝化的交替運行來達到脫氮除磷的效果，此處通過設置水解酸化池將后續好氧處理出水部分回流至水解酸化池來實現。
(6)廢水經過水解酸化池后進入好氧池，此處將好氧池分為兩段，它的好處在于在不同的好氧段，微生物根據環境不同而呈現空間的分布，具備針對性，有著更好的去除效果。
(7)廢水經過前端各個生化處理設施處理后，有機污染負荷很大程度得到降解。但廢水中色度依然難以達標，為了對色度的去除，同時考慮對COD的降低和氨氮及總磷的降低，可設置混凝沉淀池并投加針對性藥劑。
(8)沉淀池出水，進入消毒池，然后終達標排放。